發酵一般來說，是藉由微生物來分解有機物並形成腐植質。
而其過程則可分為2種形式，一種是厭氧過程，另一種則是好氧過程。
在厭氧發酵過程裡，厭氧菌在充斥著有機物、水分以及二氧化碳的環境中會產出像是氨與甲烷等有害物質以及一些其他的最終產物。
而在好氧發酵過程裡，好氧菌在適當的環境中(具有水分、氧氣以及有機物)則會產生水、二氧化碳與氧化物以及硝酸鹽.......等。
雖然這兩種發酵過程都會產生一些氣味，但假如能正確的利用好氧發酵技術，則其發酵過程中所產生的氣味將會比厭氧發酵來得小。
下列的幾項因素是掌控好氧發酵速度的關鍵 :
(1)供氧量
(2)濕度
(3)有害物質
(4)微生物所需之養分含量(ex : 磷、鉀.........)
其中，(1)與(2)與(3)都互有關聯。
而(1)又與我們所選用的木屑顆粒大小有著密切的關係，可以想見的，若木屑顆粒太細緻則將會直接影響到好氧菌進行發酵作用，因為木屑中的含氧量不足。
我們或許可以藉由翻推木屑來增加木屑中之含氧量，但關鍵的是，我們應該多久才進行一次木屑的翻推作業?
就目前我所搜尋到的paper來看，不同菌種所能承受的環境壓力都不同，而這些環境壓力可能來自於外界的污染物(3)或是發酵過程中所產生的酸性物質(3)以及有毒物質(3)。
大量的研究結果指出，某些生物物種對外界惡劣環境(像是冷凍、加熱、乾燥、滲透壓、毒性化合物.......等)所表現出的承受力和牠們體內所存在的海藻糖有直接關係。
而牠們體內的海藻糖含量則會隨著時間的推演而有增加以及減少的現象。
因此，我們在決定翻推木屑的頻率時，或許也應該考量木屑中之菌種對於環境的忍受力。
除此之外，木屑之濕度(2)以及木屑添加物之百分比(4)要在什麼範圍內才不會影響到發酵作用的進行同樣也是一個值得我們深思的問題。
最後，假如我們採用酵母來協助進行發酵，則或許還得再考慮酵母活性最強時之溫度範圍也不一定.................
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